Статьи:
- Petukhova, N., Zabelkin, A., Dravgelis, V., Aganezov, S., & Alexeev, N. (2022). Chromothripsis Rearrangements Are Informed by 3D-Genome Organization. В L. Jin & D. Durand, Lecture Notes in Computer Science (Т. 13234, сс. 221–231). Springer International Publishing. https://doi.org/10.1007/978-3-031-06220-9_13
- Bug, D. S., Tishkov, A. V., Moiseev, I. S., Porozov, Y. B., & Petukhova, N. V. (2021). Towards understanding the pathogenicity of drosha mutations in oncohematology. Cells, 10(9), 2357. https://doi.org/10.3390/cells10092357
- Bug, D. S., Tishkov, A. V., Moiseev, I. S., & Petukhova, N. V. (2021). Evaluating the effect of 3′-UTR variants in Dicer1 and Drosha on their tissue-specific expression by miRNA target prediction. Current Issues in Molecular Biology, 43(2), 605–617. https://doi.org/10.3390/cimb43020044
- Moiseev, I. S., Tcvetkov, N. Y., Barkhatov, I. M., Barabanshikova, M. V., Bug, D. S., Petuhova, N. V., Tishkov, A. V., Bakin, E. A., Izmailova, E. A., Shakirova, A. I., Kulagin, A. D., & Morozova, E. V. (2021). High mutation burden in the checkpoint and micro-RNA processing genes in myelodysplastic syndrome. PLOS ONE, 16(3), e0248430. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0248430
- Bug, D., Prikhodko, A., Bakin, E., Tishkov, A., Petukhova, N., Barkhatov, I., Morozova, E., & Moiseev, I. (2020). Building and evaluation of bioinformatic pipeline for determination of clonal profiles in myelodysplastic syndrome. Information and Control Systems, 6, 50–59. https://doi.org/10.31799/1684-8853-2020-6-50-59
- Tsvetkov, N. Y., Morozova, E. V., Barkhatov, I. M., Moiseev, I. S., Barabanshchikova, M. V., Tishkov, A. V., Bug, D. S., Petukhova, N. V., Izmailova, E. A., Bondarenko, S. N., & Afanasyev, B. V. (2020). Prognostic value of next-generation sequencing data in patients with myelodysplastic syndrome. Clinical oncohematology, 13(2), 170–175. https://doi.org/10.21320/2500-2139-2020-13-2-170-175
- Bug, D. S., Barkhatov, I. M., Gudozhnikova, Y. V., Tishkov, A. V., Zhulin, I. B., & Petukhova, N. V. (2020). Identification and characterization of a novel CLCN7 variant associated with osteopetrosis. Genes, 11(11), 1242. https://doi.org/10.3390/genes11111242
- Liu, J., Murali, T., Yu, T., Liu, C., Sivakumaran, T. A., Moseley, H. N. B., Zhulin, I. B., Weiss, H. L., Durbin, E. B., Ellingson, S. R., Liu, J., Huang, B., Hallahan, B. J., Horbinski, C. M., Hodges, K., Napier, D. L., Bocklage, T., Mueller, J., Vanderford, N. L., … Arnold, S. M. (2019). Characterization of squamous cell lung cancers from Appalachian Kentucky. Cancer Epidemiology Biomarkers & Prevention, 28(2), 348–356. https://doi.org/10.1158/1055-9965.EPI-17-0984
- Petukh, M., & Zhulin, I. B. (2018). Comparative study of the effect of disease causing and benign mutations in position Q92 on cholesterol binding by the NPC1 n-terminal domain. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, 86(11), 1165–1175. https://doi.org/10.1002/prot.25597
- Adebali, O., Petukh, M. G., Reznik, A. O., Tishkov, A. V., Upadhyay, A. A., & Zhulin, I. B. (2017). Class III histidine kinases: A recently accessorized kinase domain in putative modulators of type iv pilus-based motility. Journal of Bacteriology, 199(18). https://doi.org/10.1128/JB.00218-17
- Adebali, O., Reznik, A. O., Ory, D. S., & Zhulin, I. B. (2016). Establishing the precise evolutionary history of a gene improves prediction of disease-causing missense mutations. Genetics in Medicine, 18(10), 1029–1036. https://doi.org/10.1038/gim.2015.208
Участие в конференциях:
- Bug, D., Tishkov, A., Moiseev, I., Porozov, Y., Petukhova, N. Assessment of miRNA biogenesis genes variants in MDS development and progression. EHA2022 Congress, Vienna, Austria, June 9-12, 2022 (poster)
- Petukhova, N., Zabelkin, A., Dravgelis, V., Aganezov, S., Alexeev, N. Chromothripsis Rearrangements Are Informed by 3D-Genome Organization. The 19th Annual Satellite Conference of RECOMB on Comparative Genomics, La Jolla, USA, May 20-21, 2022 (oral presentation)
- Кузовенкова Д.А. Исследование патогенности мутации V281L в гене CYP21A2 при врожденной гиперплазии надпочечников. XI Конгресс молодых ученых, Санкт-Петербург, 4-6 апреля 2022 г. (устный доклад)
- Буг Д. С. Анализ интерфейса взаимодействия ACE2 и S-белка в задаче определения круга хозяев SARS-CoV-2. XXVII Всероссийская конференция молодых учёных с международным участием "Актуальные проблемы биомедицины - 2021", Санкт-Петербург, 25-26 марта 2021 г. (устный доклад)
- Горбач М. А. Реконструкция эволюционного развития хлорных каналов - суперсемейства генов CLCN. XXVII Всероссийская конференция молодых учёных с международным участием "Актуальные проблемы биомедицины - 2021", Санкт-Петербург, 25-26 марта 2021 г. (устный доклад)
- Буг Д. С. Анализ клональной эволюции у пациентов с миелодиспластическим синдромом. VI Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием "Генетика опухолей кроветворной системы - от диагностики к терапии", Санкт-Петербург, 28-29 мая 2021 г. (устный доклад)
- Буг Д. С., Петухова Н. В., Гиндина Т. Л., Тишков А. В. Опыт исследования хромотрипсиса в биоинформатике. IV международная конференция "NGS в медицинской генетике", Суздаль, 24-26 апреля 2019 г. (устный доклад)
- Буг Д. С. Биоинформатический анализ генетических полиморфизмов уромодулина. XVI Санкт-Петербургская международная конференция "Региональная информатика (РИ-2018)", Санкт-Петербург, 24-26 октября 2018 г. (устный доклад)
- Буг Д. С., Радионова М. В., Фильченко И. А., Приходько А. А. Подходы к изучению синдрома Ретта средствами биоинформатики. XXIV Всероссийская конференция молодых учёных с международным участием "Актуальные проблемы биомедицины - 2018", Санкт-Петербург, 12-13 апреля 2018 г. (устный доклад)
- Буг Д. С., Фильченко И. А., Радионова М. В. Поиск ортологов метил-CpG-связывающего белка в задаче определения мутации MeCP2 у больных синдромом Ретта. XXIV Всероссийская конференция молодых учёных с международным участием "Актуальные проблемы биомедицины - 2018", Санкт-Петербург, 12-13 апреля 2018 г. (устный доклад)